研究批次 · 指南
研究批次 · FTIR.fun
指南

研究批次 — 使用方法

当你的科学问题依赖一系列 FTIR 光谱而不是单个文件时,请使用 Research Batch:例如处理条件、浓度、配方、时间点或带有重复样本的生物学分组。该工作流会在你从组间模式分析转向其背后的光谱区域时,保持研究结构清晰可见。

在以下情况下选择此工作流实验组之间的比较

当重复样本和独立样品对科学结论很重要时使用;如果您只需要识别一条未知光谱,则不适用。

它帮助回答的问题各组之间是否存在差异?它们的一致性如何?哪些谱带能够解释这种差异?

相似性、PCA、聚类和峰差异是同一研究的不同视角,应结合起来进行解释。

您可以延续使用的内容用于统计、图表和手稿审阅的数值证据

导出数值,而不是依赖截图,同时保留样品归属和光谱证据,以便共同作者或后续分析使用。

此工作台的用途

  • 将多个光谱组织为样品、重复样本和可选类别。
  • 使用相似度指标比较光谱和分离物均值。
  • 运行 PCA,以显示整个批次中的主要变化模式。
  • 构建 UPGMA 聚类,以显示样品之间的相对关系。
  • 突出显示所定义组之间存在差异的峰。
  • 当每个类别至少有 5 个独立分离株时,可以建立 SIMCA 风格的类别模型。

何时使用 Research Batch

  • 配方系列、处理组、时间点或生物学组别。
  • 实验内重复样的一致性检查。
  • 探索性模式、分组和离群值审查。
  • 寻找有助于解释预定义组之间差异的谱带。

重要提示: Research Batch 提供探索性的数值证据。PCA 或聚类中的组间分离本身并不能证明化学身份或因果关系。

四步工作流程

1上传光谱上传您研究中的 FTIR 文件。一次可批量添加多个文件。
2描述样品将每个文件分配给样品、平行样或分离物,并可选择性地添加类别标签。对于较大的批次,请使用元数据 CSV 选项。
3运行分析工作台根据所选设置计算相似度、PCA、聚类和峰差异。
4审阅并导出检查图和表,然后导出数值结果,以便进行独立统计分析或编制报告。

样品与重复样分配

使用在软件之外也具有明确含义的样品 ID。重复样应代表对同一样品的重复测量;当独立分离物代表不同的实验单元时,应保持其可区分性。

  • 样本 ID — 样品或实验单元的稳定名称。
  • 重复样 / 分离物 — 使用归属字段,确保重复测量和独立样本得到正确分组。
  • 类别标签 — 可选的预定义组,例如对照组、处理组或配方组。

分析范围和归一化

指纹区间: 默认分析范围为 1800–900 cm⁻¹。如果您的实验方案要求使用不同区域,请进行更改;选定范围之外的峰不用于这些计算。

归一化: 矢量归一化为默认设置。在适用于您的数据集时,也可使用 SNV。请确保您打算比较的各光谱采用一致的预处理方法。

结果选项卡的含义

  • 相似性矩阵 — 使用可用的相似度或距离指标,对光谱或分离物均值进行两两比较。
  • PCA 与 SIMCA — PCA得分和解释方差;当数据满足类别模型要求时,将显示类别模型诊断结果。
  • 聚类 — 显示分析特征空间中相对关系的 UPGMA 树状图。
  • 峰值差异 — 组间差异最显著的谱带及现有的统计学证据。
  • 样本 — 分析中使用的文件和元数据。

SIMCA 风格的类别模型

该类别模型要求每个类别至少包含 5 个相互独立的分离株。这是基于该批次数据建立的校准模型,而非经过独立验证的分类器。在将模型视为预测性分类方法之前,请使用外部验证。

导出结果

使用 CSV、Excel 或 JSON 导出来保留数值结果,并在 FTIR.fun 之外继续分析。与截图相比,导出的数值更适合进行独立统计和记录保存。

常见问题解答

我一次可以分析多少条光谱?
大批量数据需要更长时间处理,并可能使图表或表格更难阅读。实际容量取决于文件大小、所选分析和服务器资源,因此在需要时,请将非常大的研究拆分为具有实际意义的批次。
如果我没有平行样怎么办?
当符合您的实验设计时,将每个文件视为一个独立样本。不要仅为满足分析要求而虚构重复关系。
我可以比较来自不同仪器的光谱吗?
是的,但仪器、附件、分辨率、采样和预处理方面的差异可能会造成表观上的组间分离。尽可能统一采集和预处理条件,并谨慎解读仪器间差异。
显著的峰差异能确定化学原因吗?
不。它识别出需要调查的光谱差异。使用化学背景、文献证据、标准品或其他分析方法支持该归属。
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