Tek bir bilinmeyen spektrumu tanımlamanız gerektiğinde değil, tekrarların ve bağımsız numunelerin bilimsel sonuç açısından önemli olduğu durumlarda kullanın.
Araştırma Grubu — Nasıl Kullanılır
Bilimsel sorunuz tek bir dosya yerine bir dizi FTIR spektrumuna dayanıyorsa Research Batch'i kullanın: işlemler, konsantrasyonlar, formülasyonlar, zaman noktaları veya tekrarlı biyolojik gruplar. İş akışı, grup örüntülerinden bunların arkasındaki spektral bölgelere ilerlerken çalışma yapısını görünür tutar.
Benzerlik, PCA, kümeleme ve pik farklılıkları aynı çalışmanın farklı görünümleridir ve birlikte yorumlanmalıdır.
Ekran görüntülerine güvenmek yerine değerleri dışa aktarın; numune atamasını ve spektral kanıtları ortak yazarlar veya sonraki analizler için erişilebilir tutun.
Bu çalışma tezgahı ne işe yarar?
- Çok sayıda spektrumu numuneler, tekrarlar ve isteğe bağlı sınıflar halinde düzenler.
- Spektrumları ve izolat ortalamalarını benzerlik metrikleriyle karşılaştırır.
- Parti genelindeki temel değişim örüntülerini göstermek için PCA'yı çalıştırır.
- Göreli numune ilişkilerini göstermek için UPGMA kümelemesi oluşturur.
- Tanımlanan gruplar arasında farklılık gösteren pikleri vurgular.
- Sınıf başına en az 5 bağımsız izolat bulunduğunda SIMCA tarzı bir sınıf modeli oluşturabilir.
Research Batch ne zaman kullanılmalı
- Formülasyon serileri, işlem grupları, zaman noktaları veya biyolojik gruplar.
- Bir deney içindeki tekrarların tutarlılık kontrolleri.
- Keşifsel desen, gruplama ve aykırı değer incelemesi.
- Önceden tanımlanmış gruplar arasındaki farklılıklara katkıda bulunan bantları bulma.
Önemli: Research Batch, keşif amaçlı sayısal kanıtlar sunar. PCA veya kümelemedeki grup ayrımı, tek başına kimyasal kimliğin veya nedenselliğin kanıtı değildir.
Dört adımlı iş akışı
Numune ve tekrarlı numune ataması
Yazılım dışında da anlamlı olan numune kimlikleri kullanın. Tekrar ölçümleri aynı numunenin tekrarlanan ölçümlerini temsil etmelidir; bağımsız izolatlar ayrı deney birimlerini temsil ettiklerinde birbirinden ayırt edilebilir kalmalıdır.
- Örnek Kimliği — Numune veya deneysel birim için kararlı bir ad.
- Tekrarlı numune / izole numune — Tekrarlı ölçümlerin ve bağımsız numunelerin doğru şekilde gruplandırılmasını sağlamak için atama alanlarını kullanın.
- Sınıf etiketi — Kontrol, Tedavi veya formülasyon grubu gibi isteğe bağlı, önceden tanımlanmış bir grup.
Analiz aralığı ve normalizasyon
Parmak izi aralığı: Varsayılan analiz aralığı 1800–900 cm⁻¹'dir. Protokolünüz farklı bir bölge gerektirdiğinde bu aralığı değiştirin; seçilen aralığın dışındaki pikler bu hesaplamalarda kullanılmaz.
Normalizasyon: Vektör normalizasyonu varsayılandır. Veri kümeniz için uygun olduğunda SNV de kullanılabilir. Karşılaştırmayı amaçladığınız spektrumlar genelinde ön işleme işlemlerini tutarlı tutun.
Sonuç sekmelerinin anlamı
- Benzerlik Matrisi — Mevcut benzerlik veya uzaklık metriklerini kullanarak spektrumların ya da izolat ortalamalarının ikili karşılaştırması.
- PCA ve SIMCA — PCA skorları ve açıklanan varyans; veriler sınıf modeli gerekliliklerini karşıladığında sınıf modeli tanılamaları gösterilir.
- Kümeleme — Analiz edilen özellik uzayındaki göreli ilişkileri gösteren UPGMA dendrogramı.
- Pik Farklılıkları — En güçlü grup farklılıklarını gösteren bantlar ve mevcut istatistiksel kanıtlar.
- Numuneler — Analizde kullanılan dosyalar ve meta veriler.
SIMCA tarzı sınıf modeli
Sınıf modeli, her sınıf için en az 5 bağımsız izolat gerektirir. Bu, bağımsız olarak doğrulanmış bir sınıflandırıcı değil, gruptaki verilerden oluşturulmuş bir kalibrasyon modelidir. Bir modeli öngörücü bir sınıflandırma yöntemi olarak değerlendirmeden önce harici doğrulama kullanın.
Sonuçları dışa aktarın
Sayısal sonuçları korumak ve FTIR.fun dışında analizlere devam etmek için CSV, Excel veya JSON dışa aktarımlarını kullanın. Dışa aktarılan değerler, bağımsız istatistikler ve kayıt tutma işlemleri için ekran görüntülerinden daha uygundur.
