ชุดงานวิจัย — วิธีใช้งาน

ใช้ Research Batch เมื่อคำถามทางวิทยาศาสตร์ของคุณขึ้นอยู่กับชุดสเปกตรัม FTIR หลายชุดแทนที่จะเป็นไฟล์เดียว เช่น การบำบัด ความเข้มข้น สูตรตำรับ จุดเวลา หรือกลุ่มชีวภาพที่มีการทำซ้ำ เวิร์กโฟลว์นี้ช่วยให้โครงสร้างของการศึกษายังคงมองเห็นได้ ขณะที่คุณเปลี่ยนจากรูปแบบของกลุ่มไปสู่บริเวณสเปกตรัมที่อยู่เบื้องหลังรูปแบบเหล่านั้น

เลือกเวิร์กโฟลว์นี้สำหรับการเปรียบเทียบระหว่างกลุ่มการทดลอง

ใช้เมื่อการทำซ้ำและตัวอย่างอิสระมีความสำคัญต่อข้อสรุปทางวิทยาศาสตร์ ไม่ใช่เมื่อคุณเพียงต้องการระบุสเปกตรัมที่ไม่ทราบชนิดหนึ่งชุด

คำถามที่ช่วยตอบกลุ่มตัวอย่างแตกต่างกันหรือไม่ มีความสอดคล้องกันเพียงใด และแถบใดอธิบายความแตกต่างนั้น

ความคล้ายคลึง PCA การจัดกลุ่ม และความแตกต่างของพีก เป็นมุมมองที่แตกต่างกันของการศึกษาเดียวกัน และควรตีความร่วมกัน

สิ่งที่คุณสามารถนำไปใช้ต่อได้หลักฐานเชิงตัวเลขสำหรับสถิติ รูปภาพ และการทบทวนต้นฉบับ

ส่งออกค่าแทนการพึ่งพาภาพหน้าจอ พร้อมเก็บข้อมูลการกำหนดตัวอย่างและหลักฐานสเปกตรัมไว้สำหรับผู้เขียนร่วม หรือการวิเคราะห์ในภายหลัง

เวิร์กเบนช์นี้ทำอะไร

จัดระเบียบสเปกตรัมจำนวนมากเป็นตัวอย่าง การทำซ้ำ และคลาสเสริมตามตัวเลือก
เปรียบเทียบสเปกตรัมและค่าเฉลี่ยของไอโซเลตด้วยเมตริกความคล้ายคลึง
เรียกใช้ PCA เพื่อแสดงรูปแบบหลักของความแปรผันทั่วทั้งชุดตัวอย่าง
สร้างการจัดกลุ่มแบบ UPGMA เพื่อแสดงความสัมพันธ์เชิงสัมพัทธ์ระหว่างตัวอย่าง
เน้นพีคที่แตกต่างกันระหว่างกลุ่มที่กำหนด
สามารถสร้างแบบจำลองคลาสในรูปแบบ SIMCA ได้เมื่อมีตัวอย่างแยกอิสระอย่างน้อย 5 ตัวอย่างต่อคลาส

ควรใช้ Research Batch เมื่อใด

ชุดสูตรตำรับ กลุ่มการทดลอง จุดเวลา หรือกลุ่มชีวภาพ
การตรวจสอบความสอดคล้องของการทำซ้ำภายในการทดลอง
การสำรวจรูปแบบ การจัดกลุ่ม และการตรวจสอบค่าผิดปกติ
การค้นหาแถบสเปกตรัมที่มีส่วนทำให้เกิดความแตกต่างระหว่างกลุ่มที่กำหนดไว้ล่วงหน้า

สำคัญ: Research Batch ให้หลักฐานเชิงตัวเลขในเชิงสำรวจ การแยกกลุ่มใน PCA หรือการจัดกลุ่ม ไม่ถือเป็นหลักฐานยืนยันเอกลักษณ์ทางเคมีหรือเหตุและผลได้ด้วยตัวมันเอง

ขั้นตอนการทำงานในสี่ขั้นตอน

1อัปโหลดสเปกตรัมอัปโหลดไฟล์ FTIR จากการศึกษาของคุณ สามารถเพิ่มไฟล์หลายไฟล์ได้ในชุดเดียว

2อธิบายตัวอย่างกำหนดไฟล์แต่ละไฟล์ให้กับตัวอย่าง การทำซ้ำ หรือไอโซเลต และป้ายกำกับคลาสที่เป็นทางเลือก สำหรับชุดข้อมูลขนาดใหญ่ ให้ใช้ตัวเลือก CSV เมทาดาทา

3เรียกใช้การวิเคราะห์เวิร์กเบนช์จะคำนวณความคล้ายคลึง PCA การจัดกลุ่ม และความแตกต่างของพีคโดยใช้การตั้งค่าที่เลือก

4ตรวจทานและส่งออกตรวจสอบกราฟและตาราง จากนั้นส่งออกผลลัพธ์เชิงตัวเลขเพื่อใช้ในการวิเคราะห์ทางสถิติหรือการจัดทำรายงานอย่างอิสระ

การกำหนดตัวอย่างและตัวอย่างซ้ำ

ใช้รหัสตัวอย่างที่มีความหมายเมื่ออยู่นอกซอฟต์แวร์ ตัวอย่างซ้ำควรเป็นตัวแทนของการวัดซ้ำจากตัวอย่างเดียวกัน ส่วนตัวอย่างที่แยกจากกันโดยอิสระควรยังคงสามารถแยกแยะได้เมื่อเป็นตัวแทนของหน่วยทดลองที่แยกจากกัน

รหัสตัวอย่าง — ชื่อที่คงที่สำหรับตัวอย่างหรือหน่วยทดลอง
ตัวอย่างซ้ำ / แยกเดี่ยว — ใช้ฟิลด์การกำหนดเพื่อจัดกลุ่มการวัดซ้ำและตัวอย่างอิสระให้ถูกต้อง
ป้ายกำกับคลาส — กลุ่มที่กำหนดไว้ล่วงหน้า (ไม่บังคับ) เช่น กลุ่มควบคุม กลุ่มทดลอง หรือกลุ่มสูตรตำรับ

ช่วงการวิเคราะห์และการปรับมาตรฐาน

ช่วงลายนิ้วมือ: ช่วงการวิเคราะห์เริ่มต้นคือ 1800–900 cm⁻¹ เปลี่ยนช่วงดังกล่าวเมื่อระเบียบวิธีของคุณกำหนดให้ใช้บริเวณอื่น ยอดสเปกตรัมที่อยู่นอกช่วงที่เลือกจะไม่ถูกนำไปใช้ในการคำนวณเหล่านั้น

การทำให้เป็นมาตรฐาน: การปรับเวกเตอร์ให้เป็นมาตรฐานเป็นค่าเริ่มต้น นอกจากนี้ยังมี SNV ให้ใช้เมื่อเหมาะสมกับชุดข้อมูลของคุณ ควรรักษาการประมวลผลเบื้องต้นให้สอดคล้องกันสำหรับสเปกตรัมทั้งหมดที่คุณต้องการเปรียบเทียบ

ความหมายของแท็บผลลัพธ์

เมทริกซ์ความคล้ายคลึง — การเปรียบเทียบแบบคู่ของสเปกตรัมหรือค่าเฉลี่ยของไอโซเลตโดยใช้เมตริกความคล้ายคลึงหรือระยะห่างที่มีอยู่
PCA และ SIMCA — แสดงคะแนน PCA และความแปรปรวนที่อธิบายได้ โดยจะแสดงการวินิจฉัยโมเดลจำแนกกลุ่มเมื่อข้อมูลเป็นไปตามข้อกำหนดของโมเดลจำแนกกลุ่ม
การจัดกลุ่ม — เดนโดรแกรม UPGMA ที่แสดงความสัมพันธ์เชิงสัมพัทธ์ในปริภูมิคุณลักษณะที่วิเคราะห์
ความแตกต่างของพีค — แถบสเปกตรัมที่มีความแตกต่างระหว่างกลุ่มมากที่สุดและหลักฐานทางสถิติที่มีอยู่
ตัวอย่าง — ไฟล์และเมทาดาทาที่ใช้ในการวิเคราะห์

โมเดลคลาสในรูปแบบ SIMCA

แบบจำลองคลาสต้องมีไอโซเลตอิสระอย่างน้อย 5 ไอโซเลตต่อคลาส แบบจำลองนี้เป็นแบบจำลองการสอบเทียบที่สร้างจากข้อมูลในแบตช์ ไม่ใช่ตัวจำแนกประเภทที่ผ่านการตรวจสอบความถูกต้องอย่างเป็นอิสระ ควรใช้การตรวจสอบความถูกต้องภายนอกก่อนที่จะถือว่าแบบจำลองนี้เป็นวิธีการจำแนกประเภทเชิงพยากรณ์

ส่งออกผลลัพธ์

ใช้ไฟล์ส่งออก CSV, Excel หรือ JSON เพื่อเก็บรักษาผลลัพธ์เชิงตัวเลขและดำเนินการวิเคราะห์ต่อภายนอก FTIR.fun ค่าที่ส่งออกเหมาะสมกว่าภาพหน้าจอสำหรับสถิติอิสระและการจัดเก็บบันทึก

คำถามที่พบบ่อย

ฉันวิเคราะห์สเปกตรัมพร้อมกันได้กี่รายการ

ชุดข้อมูลขนาดใหญ่ใช้เวลาประมวลผลนานขึ้น และอาจทำให้กราฟหรือตารางอ่านได้ยากขึ้น ความจุในการใช้งานจริงขึ้นอยู่กับขนาดไฟล์ การวิเคราะห์ที่เลือก และทรัพยากรของเซิร์ฟเวอร์ ดังนั้นควรแบ่งการศึกษาขนาดใหญ่มากออกเป็นชุดที่มีความหมายเมื่อจำเป็น

ถ้าฉันไม่มีตัวอย่างซ้ำจะทำอย่างไร?

ปฏิบัติต่อไฟล์แต่ละไฟล์เป็นตัวอย่างอิสระเมื่อสอดคล้องกับการออกแบบการทดลองของคุณ อย่าสร้างความสัมพันธ์ของตัวอย่างซ้ำขึ้นมาเองเพียงเพื่อให้เป็นไปตามข้อกำหนดของการวิเคราะห์

ฉันสามารถเปรียบเทียบสเปกตรัมจากเครื่องมือต่างชนิดกันได้หรือไม่?

ใช่ แต่ความแตกต่างของเครื่องมือ อุปกรณ์เสริม ความละเอียด การเก็บตัวอย่าง และการเตรียมข้อมูลล่วงหน้าอาจทำให้เกิดการแยกกลุ่มที่เห็นได้ชัดเจน ควรทำให้การเก็บข้อมูลและการเตรียมข้อมูลล่วงหน้ามีความสอดคล้องกันเท่าที่ทำได้ และตีความความแตกต่างระหว่างเครื่องมือต่างชนิดด้วยความระมัดระวัง

ความแตกต่างของพีคที่มีนัยสำคัญสามารถระบุสาเหตุทางเคมีได้หรือไม่

ไม่ใช่ การระบุนี้ชี้ให้เห็นความแตกต่างทางสเปกตรัมที่ควรตรวจสอบ ใช้บริบททางเคมี หลักฐานจากเอกสารอ้างอิง มาตรฐาน หรือวิธีการวิเคราะห์อื่นเพื่อสนับสนุนการระบุ