Swp Ymchwil · Canllaw
Swp Ymchwil · FTIR.fun
Canllaw

Swp Ymchwil — Sut i'w Ddefnyddio

Defnyddiwch Swp Ymchwil pan fydd eich cwestiwn gwyddonol yn dibynnu ar gyfres o sbectra FTIR yn hytrach nag un ffeil: triniaethau, crynodiadau, fformwleiddiadau, pwyntiau amser neu grwpiau biolegol â dyblygu. Mae’r llif gwaith yn cadw strwythur yr astudiaeth yn weladwy wrth i chi symud o batrymau grŵp i’r rhanbarthau sbectrol sydd y tu ôl iddynt.

Dewiswch y llif gwaith hwn ar gyferCymariaethau rhwng grwpiau arbrofol

Defnyddiwch ef pan fo atgynyrchiadau a samplau annibynnol yn bwysig i’r casgliad gwyddonol, nid pan mai dim ond un sbectrwm anhysbys y mae angen i chi ei adnabod.

Y cwestiwn y mae'n helpu i'w atebA yw'r grwpiau'n wahanol, pa mor gyson ydynt, a pha fandiau sy'n esbonio'r gwahaniaeth?

Mae tebygrwydd, PCA, clystyru a gwahaniaethau brigau yn wahanol safbwyntiau ar yr un astudiaeth a dylid eu dehongli gyda'i gilydd.

Yr hyn y gallwch ei gario ymlaenTystiolaeth rifiadol ar gyfer ystadegau, ffigurau ac adolygu llawysgrifau

Allforiwch werthoedd yn hytrach na dibynnu ar sgrinluniau, gan gadw aseiniad y sampl a’r dystiolaeth sbectrol ar gael i gyd-awduron neu ar gyfer dadansoddiad diweddarach.

Beth mae'r mainc waith hon yn ei wneud

  • Trefnu sbectra lluosog yn samplau, atgynyrchiadau, a dosbarthiadau dewisol.
  • Yn cymharu sbectra a chymedrau ynysig â metrigau tebygrwydd.
  • Yn rhedeg PCA i ddangos prif batrymau amrywiad ar draws y swp.
  • Yn adeiladu clystyru UPGMA i ddangos perthnasoedd cymharol samplau.
  • Yn amlygu brigau sy'n wahanol rhwng grwpiau diffiniedig.
  • Gall adeiladu model dosbarth ar ffurf SIMCA pan fo o leiaf 5 ynysiad annibynnol ym mhob dosbarth.

Pryd i ddefnyddio Swp Ymchwil

  • Cyfresi fformiwleiddio, grwpiau triniaeth, pwyntiau amser, neu grwpiau biolegol.
  • Gwiriadau cysondeb atgynyrchiadau o fewn arbrawf.
  • Adolygu patrymau archwiliadol, grwpio, a gwerthoedd allanol.
  • Dod o hyd i fandiau sy'n cyfrannu at wahaniaethau rhwng grwpiau a ddiffiniwyd ymlaen llaw.

Pwysig: Mae Research Batch yn darparu tystiolaeth rifiadol archwiliadol. Nid yw gwahanu grwpiau mewn PCA neu glystyru, ar ei ben ei hun, yn brawf o hunaniaeth gemegol nac achosiaeth.

Y llif gwaith mewn pedwar cam

1Uwchlwytho sbectraLlwythwch y ffeiliau FTIR o'ch astudiaeth. Gellir ychwanegu ffeiliau lluosog mewn un swp.
2Disgrifiwch y samplauNeilltuwch bob ffeil i sampl, atgynhyrchiad neu ynysiad, a label dosbarth dewisol. Ar gyfer sypiau mwy, defnyddiwch yr opsiwn CSV metadata.
3Rhedeg y dadansoddiadMae'r fainc waith yn cyfrifo tebygrwydd, PCA, clystyru, a gwahaniaethau brigau gan ddefnyddio'r gosodiadau a ddewiswyd.
4Adolygu ac allforioArchwiliwch y plotiau a’r tablau, yna allforiwch y canlyniadau rhifiadol ar gyfer ystadegau neu adroddiadau annibynnol.

Aseiniad sampl a replicad

Defnyddiwch IDau sampl sy'n gwneud synnwyr y tu allan i'r feddalwedd. Dylai ailadroddiadau gynrychioli mesuriadau ailadroddus o'r un sampl; dylai ynysiadau annibynnol barhau'n wahaniaethadwy pan fyddant yn cynrychioli unedau arbrofol ar wahân.

  • ID sampl — Enw sefydlog ar gyfer y sampl neu’r uned arbrofol.
  • Replicad / ynysiad — Defnyddiwch y meysydd aseinio i gadw mesuriadau ailadroddus a samplau annibynnol wedi'u grwpio'n gywir.
  • Label dosbarth — Grŵp rhagosodedig dewisol fel Rheolydd, Triniaeth, neu grŵp fformiwleiddio.

Ystod dadansoddi a normaleiddio

Ystod olion bysedd: Yr amrediad dadansoddi rhagosodedig yw 1800–900 cm⁻¹. Newidiwch ef pan fydd eich protocol yn gofyn am ranbarth gwahanol; ni ddefnyddir brigau y tu allan i’r amrediad a ddewiswyd yn y cyfrifiadau hynny.

Normaleiddio: Normaleiddio fector yw'r rhagosodiad. Mae SNV hefyd ar gael pan fo'n briodol ar gyfer eich set ddata. Cadwch y rhagbrosesu'n gyson ar draws y sbectra rydych yn bwriadu eu cymharu.

Beth mae tabiau'r canlyniadau yn ei olygu

  • Matrics Tebygrwydd — Cymhariaeth mewn parau o sbectra neu gymedrau ynysiadau gan ddefnyddio'r metrigau tebygrwydd neu bellter sydd ar gael.
  • PCA & SIMCA — Sgoriau PCA ac amrywiant a eglurir; dangosir diagnosteg model dosbarth pan fo’r data’n bodloni gofynion y model dosbarth.
  • Clwsturo — Dendrogram UPGMA sy'n dangos y perthnasoedd cymharol yn y gofod nodweddion a ddadansoddwyd.
  • Gwahaniaethau Uchafbwyntiau — Bandiau sydd â'r gwahaniaethau grŵp cryfaf a'r dystiolaeth ystadegol sydd ar gael.
  • Samplau — Y ffeiliau a'r metadata a ddefnyddiwyd yn y dadansoddiad.

Model dosbarth yn null SIMCA

Mae’r model dosbarth yn gofyn am o leiaf 5 ynysiad annibynnol fesul dosbarth. Mae’n fodel graddnodi a adeiladwyd o’r data yn y swp, nid yn ddosbarthwr a ddilyswyd yn annibynnol. Defnyddiwch ddilysiad allanol cyn trin model fel dull dosbarthu rhagfynegol.

Allforio canlyniadau

Defnyddiwch allforion CSV, Excel, neu JSON i gadw'r canlyniadau rhifiadol a pharhau â'r dadansoddiad y tu allan i FTIR.fun. Mae'r gwerthoedd a allforiwyd yn fwy addas na sgrinluniau ar gyfer ystadegau annibynnol a chadw cofnodion.

Cwestiynau Cyffredin

Faint o sbectra y gallaf eu dadansoddi ar yr un pryd?
Mae sypiau mawr yn cymryd mwy o amser i'w prosesu a gallant wneud plotiau neu dablau'n anoddach i'w darllen. Mae'r capasiti ymarferol yn dibynnu ar faint y ffeiliau, y dadansoddiad a ddewiswyd, ac adnoddau'r gweinydd, felly rhannwch astudiaethau mawr iawn yn sypiau ystyrlon pan fo angen.
Beth os nad oes gennyf atgynyrchiadau?
Trin pob ffeil fel sampl annibynnol pan fo hynny’n cyd-fynd â’ch dyluniad arbrofol. Peidiwch â dyfeisio perthnasoedd atgynhyrchu dim ond er mwyn bodloni gofyniad dadansoddi.
A allaf gymharu sbectra o offerynnau gwahanol?
Ie, ond gall gwahaniaethau mewn offeryn, ategolyn, cydraniad, samplu a rhagbrosesu greu gwahaniad ymddangosiadol rhwng grwpiau. Cysonwch y broses gaffael a'r rhagbrosesu lle bo modd, a dehonglwch wahaniaethau rhwng offerynnau yn ofalus.
A yw gwahaniaeth brig arwyddocaol yn nodi'r achos cemegol?
Na. Mae'n nodi gwahaniaeth sbectrol i ymchwilio iddo. Defnyddiwch gyd-destun cemegol, tystiolaeth o'r llenyddiaeth, safonau, neu ddulliau dadansoddol eraill i gefnogi'r aseiniad.
Cyflwyno Gofyniad Ffurflen