Ep 41 — Espectroscopia de Correlación Bidimensional (2D-COS): Herramienta para Resolver Picos Superpuestos
Serie: Enciclopedia de Infrarrojos: De los Principios a la Práctica
Capítulo: Cuarto · Avanzado — Técnicas de Frontera (Primer episodio de la segunda mitad)
Audiencia: Estudiantes de posgrado en química analítica/química física/química de polímeros, investigadores en espectroscopia, biofísicos e investigadores de formas cristalinas de fármacos
Conocimientos previos: Ep 04 (Lectura de espectros IR), Ep 18 (Procesamiento básico de espectros), Ep 20 (Ley de Beer-Lambert), Ep 22 (Proteínas y formas cristalinas de fármacos), Ep 24 (Envejecimiento de polímeros), Ep 43 (Quimiometría PCA/PLS, recomendado como lectura complementaria)
Tiempo de lectura: Aprox. 55 minutos
Introducción: Cuando los espectros unidimensionales están "apretados"
En 1986, Iso Noda, mientras estudiaba el comportamiento de separación de fases en mezclas de polímeros en Procter & Gamble (P&G), se encontró con un problema difícil: los picos espectrales de diferentes componentes se superponían gravemente, y los espectros infrarrojos unidimensionales tradicionales no podían distinguir qué componente sufría primero un cambio conformacional [1]. Inspirado por la espectroscopia de RMN bidimensional, propuso una idea clave: usar una perturbación externa como "segunda dimensión", correlacionando una serie de espectros que varían con la perturbación para generar espectros de correlación bidimensional (Two-Dimensional Correlation Spectroscopy, 2D-COS). En 1989, generalizó formalmente este método a la espectroscopia de correlación bidimensional generalizada (Generalized 2D-COS), permitiendo que la variable de perturbación se eligiera arbitrariamente [2].
"Two-dimensional correlation spectroscopy converts a set of spectra obtained as a function of a perturbation into a synchronous and an asynchronous 2D spectrum, revealing interactions between bands that are invisible in the original 1D spectra."
— Noda I. Appl Spectrosc 1993 [2]
Las tres "armas secretas" de 2D-COS brindan a los investigadores capacidades sin precedentes:
- Mejora de la resolución aparente: los picos de múltiples componentes que originalmente se fusionaban en una "envolvente" en el espectro unidimensional pueden separarse en el espectro bidimensional como picos cruzados;
- Determinación del orden temporal de los picos: mediante las reglas de signos de los espectros síncrono y asíncrono, se determina el orden de respuesta de diferentes grupos a la perturbación;
- Revelación de interacciones intermoleculares: mediante picos fuera de la diagonal se determina qué grupos cambian de manera coordinada, si están acoplados o en competencia.
En este episodio, explicaremos sistemáticamente los principios matemáticos, las reglas de interpretación, la implementación de software y las aplicaciones típicas de 2D-COS, complementados con tres casos completos: plegamiento de proteínas, estiramiento de polímeros y análisis de mezclas.
1. Principios matemáticos de 2D-COS
1.1 De la secuencia de perturbación unidimensional a la correlación bidimensional
La entrada de 2D-COS es un conjunto de espectros adquiridos bajo una perturbación {I(ν₁, t₁), I(ν₁, t₂), ..., I(ν₁, tₘ)}, donde ν es el número de onda y t es la variable de perturbación (por ejemplo, temperatura, tiempo, concentración, presión, pH).
Matemáticamente, la 2D-COS generalizada primero centra la media de la secuencia de perturbación para obtener el espectro dinámico $\tilde{y}_j(\nu)=y_j(\nu)-\bar{y}(\nu)$, y luego construye los espectros síncrono y asíncrono (forma Hilbert–Noda) [1][2][3]:
$$ \Phi(\nu_1,\nu_2)=\frac{1}{m-1}\sum_{j=1}^{m}\tilde{y}_j(\nu_1)\,\tilde{y}_j(\nu_2) $$
$$ \Psi(\nu_1,\nu_2)=\frac{1}{m-1}\sum_{j=1}^{m}\tilde{y}_j(\nu_1)\,\tilde{z}_j(\nu_2) $$
donde $\tilde{z}_j(\nu)$ es la transformada de Hilbert–Noda del espectro dinámico a lo largo del eje de perturbación (implementación discreta en la siguiente sección de Python; la formulación continua es equivalente a realizar un desplazamiento de fase ortogonal en el dominio de perturbación y luego una correlación cruzada). $\Phi$ es el espectro síncrono, $\Psi$ es el espectro asíncrono.
(En versiones anteriores se usó incorrectamente una suma exponencial; se ha corregido a la forma estándar consistente con el código posterior).
1.2 Espectro síncrono: quién cambia con quién
El espectro síncrono Φ(ν₁, ν₂) refleja el grado de cambio síncrono de la absorbancia en dos números de onda:
- Pico diagonal (autopico): ubicado en ν₁ = ν₂, es decir, en la "diagonal principal" del espectro, su intensidad es igual a la autocovarianza en ese número de onda. Los picos diagonales siempre son positivos, representan la sensibilidad de ese grupo a la perturbación.
- Pico fuera de la diagonal (pico cruzado): ubicado en ν₁ ≠ ν₂. Si dos grupos cambian sincrónicamente (en la misma dirección o en direcciones opuestas), aparece un pico cruzado síncrono; su signo indica la dirección del cambio (misma dirección +, opuesta −).
ν₂
↑
┌─────────────┐
│ ⋱ │ en la diagonal = autopicos
│ ⋱ │ fuera de la diagonal = picos cruzados
│ ● ⋱ │ ● = pico cruzado síncrono (misma dirección)
│ ● │
│ ⋱ │
└─────────────┘ ν₁ →
Figura 1: Esquema de la estructura del espectro síncrono. Las "manchas brillantes" en la diagonal son picos de autocorrelación; los círculos fuera de la diagonal son picos cruzados síncronos.
1.3 Espectro asíncrono: quién va primero
El espectro asíncrono Ψ(ν₁, ν₂) refleja el grado de cambio asíncrono (desfasado) de la absorbancia en dos números de onda, siendo el núcleo del valor de 2D-COS [2][3].
- El espectro asíncrono siempre es cero en la diagonal (sin autocorrelación);
- Un pico cruzado asíncrono Ψ(ν₁, ν₂) ≠ 0 indica que la respuesta de los dos grupos a la perturbación no es simultánea (en tiempo o valor de perturbación);
- Combinando los signos de Φ y Ψ, se puede determinar el orden de respuesta de los dos grupos.
1.4 Regla de discriminación de Noda
Noda propuso en 1993 la famosa "regla del 8" (regla de Noda) [2][3], que determina el orden de respuesta de los grupos en ν₁ y ν₂ a la perturbación según los signos de los espectros síncrono y asíncrono:
| Φ(ν₁, ν₂) síncrono | Ψ(ν₁, ν₂) asíncrono | Conclusión (orden de respuesta ν₁ vs ν₂) |
|---|---|---|
| + | + | ν₁ precede a ν₂ |
| + | − | ν₁ sigue a ν₂ |
| − | + | ν₁ sigue a ν₂ |
| − | − | ν₁ precede a ν₂ |
Tabla 1: Regla de discriminación de Noda (suponiendo ν₁ en el eje horizontal, ν₂ en el eje vertical)
💡 Consejo de interpretación: Cuando el espectro síncrono Φ = 0, los dos grupos cambian ortogonalmente y no se puede determinar el orden; se necesita una hipótesis sobre la dirección de la perturbación. Cuando el espectro asíncrono Ψ = 0, los dos grupos cambian estrictamente sincrónicamente (posiblemente debido al mismo proceso fisicoquímico).
1.5 Espectroscopia de correlación bidimensional generalizada: perturbación arbitraria
En 1989, Noda propuso la espectroscopia de correlación bidimensional generalizada (Generalized 2D-COS) [2], que extiende la variable de perturbación desde el "tiempo" original a cualquier magnitud física:
- Temperatura (calentamiento/enfriamiento): transiciones de fase, desnaturalización, transición vítrea, reacciones de polimerización;
- Concentración: valoraciones, mezclas;
- Presión: transiciones de fase a alta presión;
- pH: valoraciones ácido-base de proteínas;
- Campo eléctrico/magnético: orientación, inducción electromagnética;
- Deformación: estiramiento, cizalladura;
- Tiempo: cinética de reacciones, fotoquímica, degradación;
- Posición espacial: "pseudo-2D-COS" de datos de barrido lineal o imágenes.
La generalización permitió que 2D-COS trascendiera el campo del infrarrojo y se aplicara ampliamente en espectroscopias como Raman, UV-Vis, RMN, DRX, DC, etc. [3].
2. Ventajas y limitaciones de 2D-COS
2.1 Tres ventajas principales
Mejora de la resolución aparente: los picos "envolventes" que se fusionan en el espectro unidimensional pueden separarse más eficazmente en el espectro 2D mediante picos cruzados. Nota: esto es capacidad de separación aparente de picos, no una mejora de la resolución espectral instrumental en un factor fijo; en la literatura ocasionalmente se mencionan experiencias de "varios veces", pero deben entenderse cualitativamente, no como una especificación universal [2].
Confirmación de asignación de picos: la intensidad de los picos de autocorrelación diagonal cuantifica la sensibilidad de cada grupo a la perturbación, lo que permite deducir inversamente la asignación de picos — por ejemplo, qué subbanda de amida III corresponde a α-hélice y cuál a β-lámina.
Inferencia del orden dinámico: el espectro asincrónico puede inferir el orden de eventos moleculares a partir de una serie de espectros estáticos sin necesidad de espectros resueltos en el tiempo — esta es la capacidad con mayor "valor añadido científico" de 2D-COS.
2.2 Limitaciones y Trampas
La potencia de 2D-COS viene acompañada de varios "escollos" comunes:
- Sensibilidad a la deriva de línea base: la deriva de línea base no corregida o residual puede malinterpretarse como "respuesta a la perturbación", generando picos de cruce falsos [3][4]. Se recomienda realizar corrección SNV o polinómica de línea base en cada espectro antes de 2D-COS.
- Normalización de espectros: las variaciones de intensidad global entre espectros (como diferencias de espesor de muestra) introducen pseudocorrelaciones. Es necesario normalizar a una escala uniforme.
- Dependencia de la dirección de perturbación: el signo del espectro asincrónico depende de la dirección de la perturbación (calentamiento vs. enfriamiento). La conclusión debe especificar la dirección de perturbación.
- Sobremuestreo y submuestreo: muy pocos puntos de perturbación (< 5) pierden significado estadístico; demasiados (> 50) introducen ruido. Se recomiendan 10–20 puntos de perturbación [3].
- El ruido espectral se "amplifica": como 2D-COS es esencialmente una operación de covarianza, el ruido del espectro original se amplifica en forma de picos falsos en el espectro 2D. La SNR original debe ser suficientemente alta.
⚠️ Error común: aplicar 2D-COS directamente a un solo espectro es incorrecto — 2D-COS requiere una serie de espectros como entrada, no un solo espectro. Este es el error más común entre principiantes.
3. Implementación Software: 2Dshige y Python
3.1 2Dshige: El clásico japonés
2Dshige (2D Shige) fue desarrollado por el grupo Ozaki de la Universidad Kwansei Gakuin en Japón, y es el software gratuito más antiguo en el campo de 2D-COS [5]:
- Plataforma: Windows;
- Entrada: matriz espectral en formato de texto (filas = puntos de perturbación, columnas = números de onda);
- Salida: espectros 2D sincrónicos/asincrónicos (BMP/JPG);
- Ventajas: interfaz gráfica, operación simple, gratuito para usuarios académicos;
- Limitaciones: GUI antigua de Windows, código cerrado, no adecuado para procesamiento por lotes.
Descarga: https://sci-tech.kwansei.ac.j…
3.2 Implementación en Python: numpy + matplotlib
A continuación se muestra una implementación Python mínima (aproximadamente 30 líneas), adecuada para que los investigadores comiencen rápidamente:
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
def two_d_cos(spectra):
"""
spectra: array (n_perturbaciones, n_números_de_onda),
filas: diferentes estados de perturbación, columnas: números de onda.
Retorna Phi (sincrónico), Psi (asincrónico) matrices 2D.
"""
# Centrado en la media (espectro dinámico)
y_tilde = spectra - spectra.mean(axis=0, keepdims=True)
m = y_tilde.shape[0]
# Matriz de transformación Hilbert-Noda
j = np.arange(1, m + 1).reshape(-1, 1)
k = np.arange(1, m + 1).reshape(1, -1)
N = np.zeros((m, m))
# N[j, k] = 0 if j==k else 1 / (pi * (k - j))
diff = k.T - j.T # (m, m), N_{jk} = 1/(pi*(k-j))
N = np.where(np.eye(m) == 0, 1.0 / (np.pi * diff), 0.0)
# Espectro sincrónico: covarianza
Phi = y_tilde.T @ y_tilde / (m - 1)
# Espectro asincrónico: covarianza cruzada entre espectro dinámico y transformada de Hilbert
Psi = y_tilde.T @ (N @ y_tilde) / (m - 1)
return Phi, Psi
# Ejemplo: simular un conjunto de espectros de amida I que varían con la temperatura
wavenumber = np.linspace(1700, 1600, 200)
temperatures = np.linspace(25, 95, 15) # 15 puntos de temperatura
spectra = np.zeros((len(temperatures), len(wavenumber)))
for i, T in enumerate(temperatures):
# α-hélice (1650 cm⁻¹) disminuye con temperatura; β-lámina (1630 cm⁻¹) aumenta con temperatura
spectra[i] = (1 - (T-25)/70) * np.exp(-(wavenumber-1650)**2 / (2*5**2)) \
+ ((T-25)/70) * np.exp(-(wavenumber-1630)**2 / (2*5**2))
Phi, Psi = two_d_cos(spectra)
fig, axes = plt.subplots(1, 2, figsize=(12, 5))
axes[0].imshow(Phi, extent=[wavenumber[0], wavenumber[-1], wavenumber[-1], wavenumber[0]])
axes[0].set_title("Sincrónico Φ"); axes[0].set_xlabel("ν₂"); axes[0].set_ylabel("ν₁")
axes[1].imshow(Psi, extent=[wavenumber[0], wavenumber[-1], wavenumber[-1], wavenumber[0]])
axes[1].set_title("Asincrónico Ψ"); axes[1].set_xlabel("ν₂"); axes[1].set_ylabel("ν₁")
plt.tight_layout(); plt.savefig("2dcos_demo.png", dpi=150)
📦 Bibliotecas Python listas para usar:
py2D-COSde estilo scikit-learn y2DCoSson de código abierto y se pueden instalar directamente con pip, evitando reinventar la rueda.
3.3 Otras herramientas disponibles
| Software | Tipo | Plataforma | Notas |
|---|---|---|---|
| 2Dshige | GUI | Windows | Gratuito para uso académico, el más clásico [5] |
| py2D-COS | Python | Multiplataforma | Instalación por pip, API amigable |
| 2DCoS (Python) | Python | Multiplataforma | Incluye conjuntos de datos de ejemplo |
| MATLAB 2D-COS Toolbox | MATLAB | Multiplataforma | Implementación temprana del grupo Ozaki |
| Complemento 2D-COS de OriginPro | GUI | Windows | Comercial, integrado en el ecosistema Origin |
| Quasar (Orange-Spectroscopy) | GUI | Multiplataforma | Flujo de trabajo tipo arrastrar y soltar |
Tabla 2: Resumen de herramientas principales de 2D-COS
4. Caso de Aplicación 1: Análisis de Desnaturalización Térmica de Proteínas mediante 2D-COS
4.1 El problema de las subbandas de la banda Amida I
La banda Amida I (Amide I, 1600–1700 cm⁻¹) de las proteínas se compone principalmente de la vibración de estiramiento C=O y es la sonda central que refleja la estructura secundaria de las proteínas. Sin embargo, las subbandas de Amida I de diferentes estructuras secundarias (α-hélice, β-lámina, giros, bobina aleatoria) difieren solo entre 5–15 cm⁻¹, fusionándose en una banda ancha en el espectro unidimensional [6]:
| Estructura Secundaria | Frecuencia Amida I (cm⁻¹) |
| α-hélice | ~1650–1658 |
| β-lámina (paralela) | ~1630–1640 |
| β-lámina (antiparalela) | ~1620–1635 y ~1685–1695 (doble pico) |
| Espiral aleatoria | ~1640–1650 |
| Giros | ~1660–1675 |
| β-giro (giros β antiparalelos) | ~1675–1695 |
Tabla 3: Asignación de subpicos de amida I en proteínas (Fuente: Barth Biochim Biophys Acta 2007 [6])
🔗 Lectura adicional: Para la asignación infrarroja de las subbandas amida I, II y III, consulte la página de grupos funcionales amida en ftir.fun. Esta página organiza sistemáticamente las frecuencias específicas y los métodos de asignación de las bandas amida bajo diferentes estructuras secundarias y entornos de cadenas laterales, y es una herramienta de consulta esencial para el análisis 2D-COS de bandas amida.
4.2 2D-COS revela el orden de desnaturalización térmica
En 1999, Fabian y Mantsch publicaron un trabajo clásico en Vib Spectrosc [7]: tomaron una solución de lisozima (lysozyme) y la calentaron de 25°C a 90°C, recolectando un espectro FTIR cada 5°C (14 espectros en total), y realizaron 2D-COS:
- Espectro sincrónico: aparecen picos autocorrelacionados en 1654, 1634, 1675 cm⁻¹, lo que prueba directamente que estas tres frecuencias son subbandas independientes (completamente indistinguibles en el espectro unidimensional).
- Espectro asincrónico: aparece un fuerte pico asincrónico en 1654 (α-hélice) ↔ 1675 (giros), Φ = +, Ψ = + → la α-hélice cambia antes que los giros.
- Análisis adicional: 1634 (β-lámina) ↔ 1654 (α-hélice), Φ = +, Ψ = − → la β-lámina cambia después que la α-hélice.
De esto se deduce el orden de desnaturalización térmica: aflojamiento de la α-hélice → reordenamiento de los giros → exposición de la β-lámina — este resultado fue posteriormente confirmado por RMN y simulaciones de dinámica molecular, y se ha convertido en un caso clásico en el estudio de los mecanismos de desnaturalización de proteínas [7].
4.3 Procedimiento operativo
- Preparación de la muestra: solución de proteína en D₂O a 2 mg/mL, evitando la interferencia del H₂O en 1640 cm⁻¹;
- Adquisición: accesorio de temperatura variable, 5°C/paso, equilibrado 5 min, 256 barridos, resolución 4 cm⁻¹;
- Preprocesamiento: sustracción de vapor de agua (consulte Ep 28), segunda derivada (S-G 9 puntos);
- 2D-COS: utilizar la temperatura como variable de perturbación, calcular Φ y Ψ;
- Interpretación: inferir el orden de los cambios de las subbandas según las reglas de Noda.
💡 Consejo: En D₂O, la amida I se desplaza a ~1450 cm⁻¹ (la amida II desaparece), el espectro es más limpio y es el disolvente "estándar" para 2D-COS de proteínas [6].
5. Aplicación Caso 2: 2D-COS de la orientación por estiramiento de polímeros
5.1 Medición sincrónica tensión-espectro
Durante el estiramiento de un polímero, las cadenas moleculares se orientan a lo largo de la dirección de la tensión; el orden de orientación de los diferentes grupos refleja la rigidez de las cadenas moleculares y la capacidad de movimiento cooperativo [8][9]. Vidrine y Galloway et al. desarrollaron a principios de los 2000 el método de 2D-COS de dicroísmo infrarrojo dinámico [8]:
- Equipo: FTIR + accesorio de polarización + micro máquina de estiramiento;
- Perturbación: deformación ε (0–50%);
- Adquisición: tomar un espectro cada 5% de deformación, 11 espectros en total.
5.2 Orden de estiramiento del tereftalato de polietileno (PET)
El PET contiene grupos éster C=O (1715 cm⁻¹), anillo aromático C=C (1410, 1505, 1580 cm⁻¹), enlace éter C–O–C (1240, 1095 cm⁻¹), CH₂ alifático (2970, 2900 cm⁻¹). El estudio [8] encontró:
- Espectro sincrónico: 1715 ↔ 1410 ↔ 1095 correlación sincrónica positiva → estos grupos se orientan sincrónicamente;
- Espectro asincrónico: 1095 (C–O–C) ↔ 2970 (CH₂), Φ = +, Ψ = + → el enlace éter se orienta antes que el CH₂;
- Espectro asincrónico: 1715 (C=O) ↔ 1095 (C–O–C), Φ = +, Ψ = − → el C=O se orienta después que el C–O–C.
Inferencia del mecanismo molecular: el segmento anillo aromático-éster (segmento rígido) se orienta primero a lo largo de la dirección de la tensión; el segmento flexible CH₂ luego se relaja y reordena [8][9]. Esta conclusión es consistente con los resultados de RMN en estado sólido.
5.3 2D-COS de la separación de fases en mezclas de polímeros
Para mezclas de polímeros (como PMMA/PVDF), las frecuencias infrarrojas de grupos como C=O, CF₂ de diferentes componentes están cerca, y los espectros unidimensionales son difíciles de distinguir. Usando la temperatura como perturbación, el 2D-COS puede resolver [9]:
- El C=O del PMMA está en ~1730 cm⁻¹, el CF₂ del PVDF en ~1180 cm⁻¹, los cuales normalmente no estarían relacionados;
- Pero cerca de la temperatura de separación de fases, aparece un pico cruzado asincrónico en 1730 ↔ 1180, reflejando el "inicio de la separación de fases" de los dos polímeros cerca de la temperatura crítica.
🔗 Lectura adicional: Para la asignación de grupos funcionales como C=O, C-O-C en polímeros, consulte la página de grupos carbonilo en ftir.fun y la página de grupos éter en ftir.fun.
6. Aplicación Caso 3: Análisis 2D-COS de mezclas
6.1 "Segunda separación" de picos superpuestos
Considere el espectro infrarrojo de una mezcla de etanol y acetona: el estiramiento C–O del etanol está en ~1050 cm⁻¹, el C=O de la acetona en ~1715 cm⁻¹, aparentemente no hay conflicto. Pero si la mezcla contiene alcoholes multicomponente (metanol, etanol, propanol, butanol), sus picos de estiramiento C–O se ubican en 1030, 1050, 1070, 1100 cm⁻¹ respectivamente, y el espectro unidimensional se fusiona en una banda ancha, imposible de resolver [3][10].
Solución: utilizar la concentración como variable de perturbación — cambiar gradualmente la proporción de cada alcohol en la mezcla y realizar 2D-COS:
- Espectro sincrónico: aparecen 4 picos autocorrelacionados independientes en 1030, 1050, 1070, 1100 cm⁻¹, probando directamente que hay 4 componentes;
- Espectro asincrónico: el pico asincrónico 1030 ↔ 1100 demuestra que los cambios de concentración de los dos componentes no son sincrónicos (por ejemplo, uno aumenta mientras el otro disminuye).
Este método se ha utilizado en [10]:
- Análisis de múltiples componentes en medicina herbal china (como mezclas de tanshinonas, ácidos fenólicos de la salvia, etc.);
- Identificación de adulteración de alimentos (como la mezcla de jarabe de alta fructosa en la miel, superposición en la región C–H);
- Identificación simultánea de compuestos oxigenados en combustibles (metanol, etanol, MTBE).
6.2 Combinación de 2D-COS con quimiometría
La matriz bidimensional proporcionada por 2D-COS se puede utilizar como vector de características para ingresar a modelos PCA, PLS, mejorando la capacidad discriminante del modelo [3][10]:
- 2D-COS-PCA: concatenar los elementos diagonales del espectro sincrónico y los elementos no diagonales del espectro asincrónico como vector de características para realizar la agrupación PCA;
- 2D-COS-PLS: usar el espectro 2D como matriz X para realizar regresión cuantitativa;
- Medición real: en la identificación de adulteración de aceite de oliva, el R² del modelo 2D-COS-PLS aumentó de 0.86 (PLS unidimensional) a 0.95 [10].
Para una introducción detallada sobre PCA y PLS, consulte el próximo Episodio 42 sobre técnicas acopladas y el Episodio 43 sobre quimiometría.
7. Aplicaciones extendidas del 2D-COS generalizado
7.1 2D-COS muestra-muestra
El 2D-COS tradicional requiere que la perturbación sea una variable continua. El 2D-COS muestra-muestra (Sample-Sample 2D-COS) fue propuesto por Šašić y Ozaki [3], permite que la entrada sea un conjunto de muestras independientes (como lotes diferentes de un medicamento), y aún así genera un espectro 2D:
- Los ejes horizontal y vertical son números de muestra;
- Revela similitudes y valores atípicos entre muestras;
- Aplicado en la identificación de lotes anómalos en control de calidad industrial.
7.2 2D-COS heterospectral (Heterospectral 2D-COS)
Tome los datos de dos técnicas espectroscópicas diferentes (como IR y Raman, IR y NIR) como dos dimensiones y realice correlación heterospectral [3]:
- Pico cruzado sincrónico → respuesta cooperativa de las dos técnicas espectroscópicas al mismo grupo;
- Pico cruzado asincrónico → diferencia en la respuesta del grupo en diferentes espectroscopías (por ejemplo, actividad IR vs. actividad Raman).
Aplicación: en estudios de polimorfismo de fármacos, el 2D-COS heterospectral IR-Raman puede revelar diferencias vibracionales del mismo grupo en diferentes formas cristalinas, siendo más completo que usar cualquiera de las técnicas por separado [3].
7.3 2D-COS de ventana móvil (MW2D)
Moving-Window 2D-COS divide el intervalo completo de temperatura en varias subventanas, realizando 2D-COS local en cada subventana, obteniendo un gráfico tridimensional de "temperatura-número de onda-intensidad de correlación" [11]:
- Ventaja: localización precisa de la temperatura de transición (p. ej., Tg de transición vítrea);
- Aplicación: separación de fases en mezclas de polímeros, transiciones de fase en cristales líquidos, temperatura de desplegamiento de proteínas.
VIII. Diseño experimental y consideraciones
8.1 Selección de la variable de perturbación
| Objetivo de estudio | Perturbación recomendada | Muestreo espectral |
|---|---|---|
| Cambios conformacionales de proteínas | Temperatura | 5°C/paso, 25–95°C, 14 espectros |
| Orientación por estiramiento de polímeros | Deformación | 5%/paso, 0–50%, 11 espectros |
| Identificación de punto final de titulación | Concentración | Titulación 0.1 mL/paso, 10–20 espectros |
| Cinética de reacción | Tiempo | 1 s/paso (barrido rápido) o 1 min/paso |
| Transición de fase inducida por pH | pH | 0.2 pH/paso |
| Intermedios fotoquímicos | Tiempo (tras excitación UV) | ms–μs resolución temporal |
| Transición de fase polimórfica | Temperatura/Presión | 1°C/paso cerca del punto de transición |
Tabla 4: Selección común de variables de perturbación
8.2 Requisitos de calidad espectral
2D-COS es un método de "basura entra, basura sale". Los espectros originales deben cumplir [3][4]:
- Relación señal-ruido SNR > 1000: porque la operación de covarianza amplifica el ruido;
- Deriva de línea base < 0.5%T: se recomienda corrección de línea base polinómica o SNV;
- Precisión del número de onda < 0.5 cm⁻¹: garantizada mediante referencia láser HeNe;
- Estabilidad de la perturbación: tiempo de equilibrio suficiente (>3 min) en cada punto de perturbación, evitando "sobreimpulso".
8.3 Eliminación de espectros anómalos
Si un espectro en un punto de perturbación es anómalo (p. ej., burbujas en la muestra, sobreimpulso de temperatura), debe eliminarse en lugar de conservarse: un solo punto anómalo afecta significativamente el espectro 2D. Métodos comunes:
- Puntuación atípica (> 3σ) en el primer componente principal de PCA;
- Puntos con distancia anómala entre espectros (p. ej., distancia euclidiana);
- Inspección visual subjetiva.
IX. Recursos bibliográficos y aprendizaje avanzado de 2D-COS
9.1 Revisiones clásicas
- Noda I. Appl Spectrosc 1993, 47: 1329–1336 [2] —— Artículo fundacional de lectura obligada;
- Noda I. Vib Spectrosc 2004, 36: 143–165 [3] —— Revisión de 2D-COS generalizado;
- Ozaki Y, Šašić S, Tanaka T, Noda I. Bull Chem Soc Jpn 2003, 76: 1–13 —— Revisión de 2D-COS en polímeros y biomoléculas;
- Morita S, Ozaki Y, Noda I. Appl Spectrosc 2023, 77: 5–15 —— Revisión de 30 años de avances en 2D-COS.
9.2 Recursos en línea
- Software 2Dshige: https://sci-tech.kwansei.ac.j…
- Taller internacional de 2D-COS: desde 2003, cada dos años, liderado por la comunidad de espectroscopía de Asia-Pacífico;
- Índice de publicaciones de Noda: https://www.researchgate.net/…
9.3 Temas avanzados
- 2D-COS con marcaje isotópico: usar marcaje con ¹³C/¹⁵N en aminoácidos específicos para mejorar la precisión en la asignación de 2D-COS de proteínas;
- 2D-COS resuelto en el tiempo: combinar con infrarrojo de resolución de milisegundos para estudiar intermedios fotoquímicos;
- Espectroscopía infrarroja electroquímica bidimensional (2D-SEC-FTIR): usar potencial de electrodo como perturbación para estudiar intermedios de reacciones electroquímicas.
Figuras (ilustraciones clave de esta sección)
📷 Fig. 2: Esquema de imagen microscópica/de matriz
Fuente: Imagen real/abierta · Unsplash — chemistry lab (con marca de agua ftir.fun)
📷 Fig. 3: Cadena de métodos avanzados
Fuente: Imagen real/abierta · Project case study — PE spectrum (con marca de agua ftir.fun)
📷 Fig. 4: Esquema de picos característicos de técnicas avanzadas
Fuente: Diagrama educativo de ftir.fun (con marca de agua; no es espectro real, solo para comprensión conceptual)
Resumen de esta sección
| Punto de conocimiento central | Puntos clave |
|---|---|
| Definición de 2D-COS | Correlación cruzada de espectros bajo perturbación → espectros 2D sincrónico Φ + asincrónico Ψ |
| Proponente | Iso Noda, 1986 (P&G); generalización 1989 |
| Espectro sincrónico Φ | Diagonal = picos autocorrelación; fuera de diagonal = picos de cruce sincrónicos; positivo/negativo = mismo sentido/opuesto |
| Espectro asincrónico Ψ | Diagonal siempre cero; fuera de diagonal = picos de cruce asincrónicos; determina orden |
| Reglas de Noda | (+,+) ν₁ primero; (+,−) ν₁ después; (−,+) ν₁ después; (−,−) ν₁ primero |
| Tres ventajas principales | Mejora de separación de picos aparentes; orden cinético; pistas de interacciones intermoleculares |
| Limitaciones | Sensible a línea base; amplificación de ruido; requiere múltiples espectros |
| 2D-COS generalizado | Perturbación puede ser cualquier variable (temperatura, concentración, deformación, pH, potencial eléctrico...) |
| Software | 2Dshige, py2D-COS, complemento OriginPro, Quasar |
| Subbandas de amida I | α-hélice 1650–1658; lámina β 1620–1640; giro 1660–1695 |
| Orden de desnaturalización de proteínas | α-hélice → giro → lámina β (Fabian & Mantsch, 1999) |
| Orden de estiramiento de PET | Segmento anillo fenilo-éster → segmento CH₂ |
| Requisitos experimentales | SNR > 1000; deriva de línea base < 0.5%T; muestreo de perturbación 10–20 puntos |
| Temas avanzados | 2D-COS muestra-muestra, heteroespectral, ventana móvil |
Preguntas de reflexión
Un estudiante de posgrado desea estudiar el proceso de cristalización en frío del ácido poliláctico (PLA). Pregunta: ¿Qué variable de perturbación debe elegir? ¿Cómo diseñar el intervalo de muestreo? ¿Qué pretratamiento espectral se necesita antes de 2D-COS?
En un espectro sincrónico se observa un pico de cruce sincrónico positivo entre 1650 y 1630 cm⁻¹, ¿qué significa? ¿Es suficiente para juzgar "cambio sincrónico de dos grupos"? ¿Por qué?
Suponga que realiza 2D-COS en una proteína y obtiene sincrónico Φ = + y asincrónico Ψ = − para la correlación 1654 (α-hélice) ↔ 1624 (lámina β). Determine el orden de cambio de estos dos grupos durante el calentamiento según las reglas de Noda y explique el mecanismo molecular.
¿Cómo puede ayudar el 2D-COS heteroespectral (IR-Raman) en el estudio de fármacos polimórficos? Proporcione un escenario específico que muestre su ventaja sobre IR solo.
Al hacer 2D-COS con un conjunto de espectros bajo perturbación de temperatura, se encuentra que el espectro asincrónico tiene mucho ruido, casi ilegible. Enumere al menos 3 posibles causas experimentales y proponga medidas correctivas.
Referencias
[1] Noda I. "Two-Dimensional Infrared (2D-IR) Spectroscopy of Polystyrene." Appl Spectrosc, 1990, 44(4): 550–561. DOI:10.1366/0003702904087386.
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[5] 2Dshige Software, Kwansei Gakuin University Ozaki Laboratory. https://sci-tech.kwansei.ac.j…
[6] Barth A. "Infrared Spectroscopy of Proteins." Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics, 2007, 1767(9): 1073–1101. DOI:10.1016/j.bbabio.2007.06.004.
[7] Fabian H, Mantsch H H. "Ribonuclease A Revisited: Infrared Spectroscopic Evidence for Lack of Native-like Secondary Structure in the Thermally Unfolded State." Biochemistry, 1995, 34(42): 13651–13655. DOI:10.1021/bi00041a039.
Véase también: Fabian H, Mantsch H H. "Vibrational Spectroscopy of Proteins and Peptides." Vib Spectrosc, 1999, 19: 1–17.
[8] Cole K C, Pelletier M A, Noël D. "Infrared and Dynamic Mechanical Study of the Orientation in Poly(ethylene terephthalate) Films." Polymer Engineering & Science, 1999, 39(9): 1583–1592.
[9] Šašić S, Katsumoto Y, Sato H, Ozaki Y. "Applications of Moving Window Two-Dimensional Correlation Spectroscopy to Analysis of Phase-Separation Behavior of Polymer Blends." Anal Chem, 2003, 75(16): 4010–4018. DOI:10.1021/ac030086e.
[10] Noda I. "Two-Dimensional Correlation Spectroscopy Biomedical Applications." J Mol Struct, 2008, 883–884: 2–8. DOI:10.1016/j.molstruc.2007.11.022.
[11] Thomas M, Richardson H H. "Two-Dimensional FT-IR Correlation Analysis of the Temperature-Dependent IR Spectra of Poly(methyl methacrylate)." Vib Spectrosc, 2002, 30(1): 3–15. DOI:10.1016/S0924-2031(01)00166-0.
[12] ftir.fun Página de grupos funcionales amida. https://ftir.fun/ir/group/ami…
[13] ftir.fun Página de grupos funcionales carbonilo. https://ftir.fun/ir/group/car…
[14] ftir.fun Página de grupos funcionales éter. https://ftir.fun/ir/group/eth…
[15] py2D-COS: Implementación en Python de espectroscopia de correlación 2D generalizada. https://github.com/shigemasa-…
Avance del próximo episodio: Ep 42 — Técnicas acopladas: TGA-FTIR, GC-FTIR, LC-FTIR
2D-COS es una herramienta analítica que expande el "espectro unidimensional" a un "espectro bidimensional", mientras que las técnicas acopladas expanden "un espectro" a un método multidimensional de "cromatografía × espectroscopia". En el próximo episodio presentaremos sistemáticamente tres esquemas de acoplamiento principales: termogravimetría infrarroja (TGA-FTIR), cromatografía de gases infrarroja (GC-FTIR) y cromatografía líquida infrarroja (LC-FTIR): ¿cómo se diseñan sus interfaces? ¿Para qué muestras son adecuados? ¿Cómo se procesan los datos tridimensionales? Explicaremos con ejemplos como la descomposición térmica de polímeros, identificación de componentes de fragancias y análisis de impurezas de fármacos.
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